חשבונית ירוקה מופקת במינימום טעויות. הטעויות האפשריות יכולות להתבטא אך ורק בהקלדה ועם בקרה נכונה של המקליד ניתן למנוע גם אותן. כך, שלשיטה זאת יש יתרונות תפעוליים רבים.
פתיחת תיק במע"מ נעשית בהליך טכני במשרדים האזוריים של מע"מ. כל עסק משויך למשרד אזורי על פי כתובתו. אין צורך להגיע פיזית וניתן למלא את הטפסים בצורה מקוונת. יכולים לעשות זאת בעלי העסק או מיופה כוח מטעמו.
פתיחת עוסק מורשה יכולה להיעשות על ידי בעל העסק או מיופה כוח מצידו ויש להצטייד במסמכים נדרשים. כך, רואה חשבון או מנהל חשבונות, עורך דין וכדומה. הרישום נעשה במשרדי רשות המיסים בתחומה הוא פועל. במידה ויש כוונה להעסיק עובדים יש צורך לפתוח תיק ניכויים ולדווח עליהם כולל למוסד לביטוח לאומי.
פתיחת תיק עוסק פטור יכולה להתבצע על ידי בעלי העסק או מיופה כוח מטעמו. בין היתר רואה חשבון, מנהל חשבונות, עורך דין וכדומה. פתיחת הדין נעשית לאחר תהליך אפיונו. יש צורך בהגדרת תחום פעילותו, בבחירת קהל היעד, המוצר או השירות שאמורים להימכר ועוד.